2006年3月23日，全国食品卫生标准委员会卫生标准协作组在京组织召开了食品微生物限量标准第二次工作组会议，会议总结了第一阶段各个行业的工作进展情况，饮料行业作为制定微生物限量标准的优先行业，也向协作组汇报行业的基本概况、产品分类、国际和其他国家相关标准、国标状况以及存在的问题。

为了全面了解企业对现行卫生标准中微生物限量的执行情况及分析存在的问题，并在保证食品卫生、安全的基础上制定出可行性较强的微生物限量标准，全国食品卫生标准委员会委托协会成立饮料产品微生物限量标准工作组，在对企业进行微生物出厂监测数据调查的基础上，提出饮料产品微生物指标的建议。协会已对一些具有代表性的企业展开数据调查，对收集的的监测数据协会也将以企业代码形式进行分析汇总，并在此基础上提出不同产品的微生物限量建议。